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DB51 T 1210-2011 《马铃薯X病毒检验鉴定技术规程》.pdf

1、ICS DB51 四川省地方标准 DB51/T 12102011 马铃薯 X 病毒检验鉴定技术规程 Detection and Identification of Potato Virus X for Quarantine 2011 - 01 - 25 发布 2011 - 03 - 01 实施四川省质量技术监督局 发布DB51/T 12012011 I 目 次 前言 II 1 范围 1 2 规范性引用文件 1 3 术语和定义 1 4 原理 1 5 试剂与材料 1 6 仪器及用具 3 7 取样 3 8 实验室检验 3 9 结果判定 4 10 样品保存 . 4 附录A(资料性附录) 马铃薯X病毒基

2、本信息 . 5 附录B(资料性附录) 马铃薯X病毒DAS-ELISA检验程序 6 附录C(资料性附录) 马铃薯X病毒RT-PCR检验程序 . 8 DB51/T 12012011 II 前 言 本标准分为范围、规范性引用文件、 术语和定义、原理、试剂与材料、仪器及用具、取样、实验室检验、结果判断、样品保存等部分。 本标准由四川省农业厅提出并归口。 本标准起草单位:四川省植物检疫站。 本标准主要起草人:宁红、郭迪金、谭家兴、谢成伦、万佳、熊玉兰、杨重渝 DB51/T 12012011 1 马铃薯 X 病毒检验鉴定技术规程 1 范围 本标准规定了马铃薯X病毒(见附录A)的取样、实验室检验、结果判断及

3、样品保存的技术要求和方法。 本标准适用于马铃薯感染马铃薯X病毒的检验和鉴定。 2 规范性引用文件 下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅所注日期的版本适用于本文件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。 GB15569-2009 农业植物调运检疫规程 DB51/T868-2009 马铃薯卷叶病毒、马铃薯Y病毒和马铃薯A病毒检验鉴定技术规程 3 术语和定义 下列术语和定义适用于本标准。 3.1 目标条带 target band 根据某种病毒RNA序列中一段保守的、特异的碱基序列设计特异引物,通过RT-PCR扩增和电泳检测,得到的与引物设计长度

4、吻合的RT-PCR扩增条带。目标条带的存在,是判断某种病毒存在的标准。本标准中PVX的目标条带为 625bp。 注:改写DB51/T868-2009,定义3.6。 4 原理 马铃薯X病毒田间通过蚜虫和农事操作进行传播,远距离主要通过人为的引种、商品流通等途径传播,带毒块茎和种苗是该病毒远距离传播的主要载体,该病毒具有潜隐性,根据病害症状很难确定马铃薯X病毒,薯块上一般不表现症状。采用免疫学和分子生物学方法,可快速根据有关判断标准进行马铃薯X病毒检验鉴定。 5 试剂与材料 除非另有说明,在本标准中仅使用确认的分析纯试剂和蒸馏水或去离子水或相当纯度的水。 5.1 免疫学检验试剂 免疫学检验试剂包括

5、: DB51/T 12012011 2 捕捉抗体(Capture antibody) 马铃薯 X 病毒免疫球蛋白,抗体稀释度按市售产品要求进行。贮藏于 4条件下备用; 酶标抗体(Alkaline pho sphatase enzyme conjugate) 用碱性磷酸酶标记的马铃薯 X 病毒的免疫球蛋白抗体。按市售产品要求进行稀释,贮藏于 4 条件下备用; 包被缓冲液(Coating buffer) 取 2.93 g碳酸氢钠(NaHCO 3)、1.59 g碳酸钠(Na 2CO3)、0.2 g叠氮化钠(NaN 3),用 1000 mL蒸馏水溶解,并调pH值到 9.6,贮藏于 4条件下备用; 洗涤

6、液(PBST Buffer) 取 1.15 g无水磷酸氢二钠(Na 2HPO4)、0.2 g氯化钾(KCl)、0.2 g无水磷酸二氢钾(KH 2PO4) 、8.0 g氯化钠(NaCl)、0.5 g 吐温20 ,用 1000 mL蒸馏水溶解,并调整pH值到 7.4; 样品提取液 (GEB buffer) 取 1.3 g 无水硫酸钠 (Na2SO4) 、20.0 g 聚乙烯吡咯烷酮( (C6H9NO)24-40000)、0.2 g 叠氮化钠(NaN3)、2.0 g 级鸡蛋清白蛋白粉、20.0 g 吐温20,用 1000 mL洗涤液溶解,并调整 pH 值到 7.4,贮藏于 4条件下备用; 酶标抗体稀

7、释缓冲液(ECI Buffer) 取 0.2 g 牛血清白蛋白(或脱脂奶粉)、2.0 g 聚乙烯吡咯烷酮(C6H9NO)n)、0.02 g 叠氮化钠(NaN3),用 100 mL 洗涤缓冲液溶解,并调整 pH 值到 7.4,贮藏于 4条件下备用; 底物缓冲液(PNP Buffer) 用 80 mL 灭菌蒸馏水将 0.01 g 氯化镁(MgCl2)、0.02 g 叠氮化钠(NaN3)、9.7 mL 二己醇胺 CH2CH2OH)溶解后,用盐酸调 pH 值到 9.8,定容到 100 mL,贮藏于 4条件下备用; 底物溶液(PNP substate) 将5 mg 对硝基苯磷酸盐(C6H5NO3)溶解于

8、 5 mL 底物缓冲液中。底物溶液制备需在孵育结束前 15 min 内,避光条件下制备; 终止液 12 g 氢氧化钠(NaOH)溶于 100 mL 蒸馏水。 5.2 RT-PCR 检验试剂 RT-PCR 检验试剂包括: 莫洛尼鼠白血病病毒反转录酶(MMLV) 100 U/ l; 1 TAE 缓冲液 40mM Tris-HCl, 20mM NaAc, 2mM EDTA(用冰醋酸调 pH 至 8.0); 5 RT 缓冲液(5x RT Buffer) 50 mM Tis-HCl PH7.5,100 mM NaCl,0.1 mM EDTA,10 mM DTT,0.01% NP-40,50%甘油; 10

9、 PCR 缓冲液 100 mM Tris-HCl (pH8.3), 500 mM KCl; MgCl 2 25 mM; RNA 酶抑制剂(RNasin) 10 U/l; RT 增强剂 (RT Ehancer); 无水乙醇(CH 3CH2OH); RL 裂解液; 去蛋白液; Taq 酶 2.5 U/l; dNTP Mixture 10 mM; 漂洗液; 双蒸水(ddH 2O); 2-巯基乙醇(MCE) C2H6OS; 液氮 (N 2); 引物 PVX 上游引物(P1)碱基序列: 5-ACAGGCCACAGGGTCAACTAC-3,PVX 下游引物(P2)碱基序列:5-CATCTAGGCTG GC

10、AAAGTCGT-3,用双蒸水稀释至 20 M; DB51/T 12012011 3 100bp DNA ladder (1500 bp); 溴酚蓝(Bromopheno l blue)C 19H10Br4O5S; 琼脂糖凝胶:称取 1.5 g 琼脂糖缓缓倒入 250 mL 三角瓶内,加入 100 mL 1TAE,在微波炉中加热 1 min 溶解后,再加入 5 L Goldview 的生物染料,倒入调平并安放适当梳齿的制胶板上,冷凝后小心拔出梳齿。 6 仪器及用具 仪器及用具包括: 聚乙烯微量滴定板 根据样品数量选用40孔和96孔两种规格; 移液器 2 L10 L、10 L50 L、10 L2

11、00 L、200 L1000 L和1 mL5 mL五种规格及配套吸头; 天平 1/100 g,1/1000 g; 培养箱; 台式高速离心机; 酶联免疫检测仪; 水平电泳仪; 凝胶成像系统; PCR扩增仪; EP管; 研钵 内径60 mm80 mm; 剪刀; 冰箱; 超低温冰箱; 过滤柱 CS过滤柱,CR吸附柱。 涡旋混匀器 7 取样 7.1 植株取样 取样方法按DB51/T868-2009 7.2和D B51/T868-2009 7.3的规定。 7.2 种薯(块茎)取样 按GB15569-20 09 6.2的规定进行抽样。 8 实验室检验 8.1 DASELISA 马铃薯X病毒检验方法见附录B

12、。如采用认可的试剂盒,按说明操作。 8.2 RT-PCR 马铃薯X病毒样品的制备与检验方法见附录C。如采用认可的试剂盒,按说明操作。 DB51/T 12012011 4 9 结果判定 9.1 DASELISA 在阴性对照OD值0.1,且阳性对照OD值大于阴性对照OD值2倍的前提下,样品孔OD值大于阴性对照OD值2倍时,判定为阳性反应,即样品带PVX;否则判定为阴性反应,即样品不带PVX。 9.2 RT-PCR 在阴性对照无扩增条带,且阳性对照出现625bp目标条带的前提下,样品RT-PCR产物电泳结果在625bp处出现目标条带,判定为阳性反应,即样品带PVX;否则判定为阴性反应,即样品不带PV

13、X。 10 样品保存 经检验鉴定后的样品,应在-80 -20 保存三个月,以备复验、谈判和仲裁,保存期满后,需进行灭活处理。 DB51/T 12012011 5 AA 附 录 A (资料性附录) 马铃薯 X 病毒基本信息 A.1 分类 马铃薯X 病毒 potato virus X ,简称PVX,又称马铃薯潜隐病毒或马铃薯轻花叶病毒,是马铃薯X病毒属的模式成员病毒粒体线形,长480 nm 580 nm ,其寄主范围广,病毒稀释限点100000 1000000 倍,钝化温度68 75 ,体外存活期1 年以上。 A.2 为害 马铃薯X病毒主要系统侵染茄科植物。在自然条件下主要靠植株不同部位之间直接接

14、触和带病种薯传播。通常引起花叶症状,某些品种感染轻微或潜伏起来,有的株系可能引起皱缩,某些株系对特定的病毒株系过敏,反应为顶部坏死。马铃薯X病毒是一种危害严重的病毒,也是传播最为广泛的一种病毒,遍布全世界马铃薯种植区,可引起10%以上的减产,田间常 与其他病毒混和感染导致马铃薯的毁灭性减产。 A.3 传播途径 田间通过蚜虫和农事操作进行传播,远距离传播主要通过人为的引种、商品流通等,带毒块茎和种苗是该病毒传播的主要载体。 DB51/T 12012011 6 BB 附 录 B (资料性附录) 马铃薯 X 病毒 DAS-ELISA 检验程序 B.1 包被抗体 B.1.1 包被 向酶联反应板每孔加入

15、100 L用包被缓冲液稀释的PVX捕捉抗体,将酶联反应板置于保湿容器中,室温孵育4 h 或4 冰箱过夜。 B.1.2 洗板 向每个反应孔中加入200 L洗涤液,迅速倒出,重复2次。洗板完成后将酶联板倒置于吸水纸上,吸干反应孔中残留液体。 B.2 点样 B.2.1 样品制备 将待测样品剪碎,取0.3 g于研钵中,加入1 mL样品提取液 充分研磨后,再加入2 mL样品提取液充分研磨至均匀。剩余样品于-20冰箱保存备查,在制样时应注意防止样品的交叉污染。 B.2.2 点样 用移液器将制备好的样品加入酶联反应板孔内,每个样品三次重复,每孔100 L。设置阳性对照、马铃薯健康组织研磨液阴性对照和包被缓冲

16、液空白对照。加样完成后将酶联反应板置于保湿容器中,室温孵育2h或4冰箱12h。 B.2.3 洗板 在每个反应孔加满洗涤液,迅速倒出,再加满洗涤液,静置3 min后将洗涤液迅速倒出。重复3次。洗板完成后将酶联板倒置于吸水纸上,吸干反应孔中残留液体。 B.3 结合酶标抗体 B.3.1 加酶标抗体 向酶联反应板每孔加入100 L用PVX酶标抗体稀释缓冲液按比例稀释的酶标抗体溶液。置于保湿容器中室温孵育2 h。 B.3.2 洗板 同B.2.3。 B.4 显色 每孔加入100 L底物溶液。25避光孵育30 min60 min,至阳性对照显色。 DB51/T 12012011 7 B.5 终止反应 显色后

17、在每孔中加入50 L 终止液。记录检测结果,存档备查。 B.6 结果测定和记录 用酶联检测仪测定并记录光密度值(OD值)。 DB51/T 12012011 8 CC 附 录 C (资料性附录) 马铃薯 X 病毒 RT-PCR 检验程序 C.1 PVX模板RNA的制备 采用TIANGEN RNApre p Plant Kit试剂盒(给出该试剂盒信息是为了方便标准使用者,如果等效产品具有相同效果,则可使用这些等效产品)提取马铃薯X病毒RNA。称取50 mg 100 mg的马铃薯叶片或茎杆(薯块需经发芽后切取幼芽),在液氮中迅速研磨成粉末状,转移粉末至预冷的1.5 mL的EP管中,加入500 L的R

18、L裂解液(使用前按RL裂解液1 mL 加入2-巯基乙醇10 L),涡旋剧烈震荡5 min使其混匀。 将匀浆液转移至CS过滤柱上, 12000 rpm 离心2 min5 min, 小心吸取上清液至无RNA酶 (RNase-free)的离心管中,吸头尽量避免接触收集管中的细胞碎片沉淀。缓慢加入上清液0.5倍体积无水乙醇,混匀,得到的溶液和沉淀一起转入CR吸附柱中,12000 rp m离心1 min,弃掉收集管中的废液,将吸附柱放回收集管中。向吸附柱CR中加入700 L去蛋白液RW1,12000 rpm 离心1 min,弃废液,将吸附柱放回收集管中。向吸附柱CR中加入500 L漂洗液RW,12000

19、 rpm离心1 min,弃废液,将吸附柱放回收集管中,重复漂洗一次。漂洗完后,将吸附柱在12000 rpm 离心2 min,,去除残余液体,并在室温下放置片刻。将吸附柱放入一个新的RNase-free离心管中, 向膜中央加入50 L100 L无RNA酶的双蒸水, 室温放置2 min,12000 rpm离心2 min,得到RNA溶液。 C.2 RT- PCR扩增 C.2.1 反转录 C.2.1.1 反应体系 RT反应体系见表B.1。 表C.1 马铃薯 X 病毒 RT 反应体系 反应物 模板RNA P2 RNasin RT Ehancer 5 RT buffer dNTP MMLV 无RNA酶的d

20、dH 2O 加入量(L) 2.5 0.5 0.5 0.5 4 1 0.5 10.5 C.2.1.2 程序 反转录程序为:42 ,50 min;94 ,5 min;4 保存。 C.2.2 PCR反应 C.2.2.1 反应体系 PCR反应体系见表B.2。 表C.2 PCR 反应体系 反应物 10PCR Buffer dNTP P1 P2 cDNA TaqDNA聚合酶 MgCl2 无RNA酶的ddH 2O加入量( L) 2.5 0.5 1 1 4 0.5 1.5 14 DB51/T 12012011 9 C.2.2.2 反应程序 反应程序为:94 3 min;94 30 sec,59 30 sec,72 30 sec,30次循环;72 10 min;4 保存。 C.3 扩增产物检测 C.3.1 琼脂糖凝胶电泳 将制胶板同制好的琼脂糖凝胶一并放入水平电泳槽,取5 L扩增反应物加0.5 L的溴酚蓝上样缓冲液混匀,以及2 L 100bp DNA ladder分别点入样孔内。电泳缓冲液1TAE适量,100 V,电泳30 min。 C.3.2 结果观察和记录 电泳结束后,取出琼脂糖凝胶,放入凝胶成像系统中,观察并记录DNA条带有无和片段大小。 _

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