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DB37 T 3086-2017 猪附红细胞体PCR检测技术.pdf

1、ICS 65.020.30 B41 DB37 山东省地方标准 DB 37/T 30862017 猪附红细胞体PCR检测技术 PCR Assay for Detection of Swine Eperythrozoon 2017 - 12 - 29发布 2018 - 01 - 29实施 山东省质量技术监督局 发布 DB37/T 30862017 前 言 本标准按照 GB/T 1.12009给出的规则起草。 本标准由山东省畜牧兽医局提出。 本标准由山东省畜牧业标准化技术委员会归口。 本标准主要起草单位:山东省农业科学院畜牧兽医研究所。 本标准主要起草人:陈蕾、杜以军、齐静、丛晓燕、孙文博、陈智、郭

2、立辉、于江、吴家强、李俊、 时建立。 I DB37/T 30862017 猪附红细胞体PCR检测技术 1 范围 本标准规定了猪附红细胞体PCR 检测技术的 操作要求 本标准适用于猪附红细胞体的实验室诊断、监测和流行病学调查等。 2 实验室生物安全要求 实验室必须为生物安全级(BSL -2级)及以上实验室。 3 规范性引用文件 下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅所注日期的版本适用于本文 件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。 GB/T 6682 分析实验室用水规格和实验方法 4 术语与定义 下列术语与定义适用于本标准。 4.1 PCR

3、 聚合酶链式反应。 4.2 SDS 十二烷基硫酸钠。 5 仪器设备和试剂 5.1 仪器设备 5.1.1 微量移液器(最大量程分别为 10 L、20 L、100 L 、1000 L),带滤芯的枪头。 5.1.2 20000 r/min 低温高速离心机。 5.1.3 电热恒温水槽。 5.1.4 稳流稳压电泳仪。 5.1.5 水平电泳槽。 5.1.6 凝胶成像系统。 5.1.7 紫外透射反射分析仪。 5.1.8 电磁炉。 5.1.9 烧杯( 1000 mL)。 1 DB37/T 30862017 5.1.10 电子天平 精度为:0.001 g。 5.1.11 PCR 扩增仪。 5.1.12 -20

4、冰柜。 5.1.13 2 8 冰箱。 5.2 试剂 除另有规定外,所有生化试剂均为分析纯。 5.2.1 蛋白酶 K(见附录 A.1)。 5.2.2 10 %SDS 液(见附录 A.2)。 5.2.3 70 %乙醇(见附录 A.3)。 5.2.4 1.0 %琼脂糖凝胶(见附录 A.4)。 5.2.5 DNA Marker DL2000。 5.2.6 超纯水:符合 GB/T 6682,三级。 5.2.7 引物: MS-Fwd:5- CGAGCGCAACCCTTCATAT-3; MS-Rev:5- CTACCATTGTAGCACGTTTGCA-3; 扩增片段大小127 bp 。 6 操作程序 6.1

5、 样品的采集和处理 6.1.1 样品的采集 临床上猪的血液(肝素抗凝血),置于2 8 冰箱保存。 6.1.2 样品的处理 6.1.2.1 取肝素抗凝血液约 5 ml。 6.1.2.2 阳性对照处理:猪附红细胞体 DNA。 6.1.2.3 阴性对照处理:灭菌双蒸水。 6.2 DNA的提取 用蛋白酶K 裂解法提取总 DNA。 6.2.1 取肝素抗凝血 500 L 于 1.5 mL 离心管中,加入 50 g/mL 的蛋白酶 K 5 L,加入 10 %的 SDS 溶液 25 L ,55 水浴 2 h3 h。 6.2.2 加入 200 L Tris 饱和酚,充分混匀, 10000 g 离心 15 min

6、 6.2.3 取上清于一新的离心管中,加入 200 L Tris 饱和酚和 200 L 氯仿,10000 g 离心 15 min。 6.2.4 取上清于一新离心管中,加入 200 L 氯仿,10000 g 离心 15 min。 6.2.5 取上清于一新离心管中,加入 2 倍体积的无 水乙醇, -20 静置 20 min,10000 g 离心 15 min, 弃上清。 6.2.6 加入 70 %的乙醇冲洗沉淀表面及管壁,弃乙醇,晾干。 6.2.7 加入 100 L 灭菌双蒸水溶解沉淀, -20 保存备用。试验中同时设立猪附红细胞体 DNA 作为 阳性对照和灭菌双蒸水作为阴性对照。 6.3 PC

7、R 2 DB37/T 30862017 PCR为50 L体系,按表 1中17 的循序配制。 表1 PCR反应体系(50L) 序号 体系组成 体系含量 1 灭菌双蒸水 37.5 L 2 DNA 4 L 3 10 mmol/L上游引物 0.5 L 4 10 mmol/L下游引物 0.5 L 5 10PCR Buffer 5 L 6 2.5 mmol/L dNTPs 2 L 7 Taq酶 0.5 L 首先加入双蒸灭菌水,然后按顺序逐一加入上述成分,每次要加入到液面下。全部加完后,混悬, 瞬时离心,使液体都沉降到PCR 管底。循环参数为 95 5 min , 94 30 s , 52 45 s, 72

8、 1 min, 循环30 次, 72 延伸 10 min结束。 6.4 电泳 6.4.1 制备 1.0 %琼脂糖凝胶板,见附录 A.4。 6.4.2 取 5 L PCR 产物与 0.5 L 加样缓冲液混合,加入琼脂 糖凝胶板的加样孔中。 6.4.3 加入分子量标准。 6.4.4 盖好电泳仪,插好电极, 5 V/cm 电压电泳, 3040 min。 6.4.5 用凝胶成像仪观察、扫描图片存档。 6.4.6 用分子量标准比较判断 PCR 片段大小。 7 结果判定 7.1 在阳性对照出现 127 bp 扩增带、阴性对照无此扩增带时,实验结果成立(参见附录 A.5)。 7.2 被检样品出现 127 b

9、p 扩增带判定为猪附红细胞体阳性,未出现相应扩增带的样品判定为猪附红细 胞体阴性(参见附录 A.6)。 3 DB37/T 30862017 A A 附 录 A (规范性附录) 试剂的配制 A.1 蛋白酶K溶液(20 mg/mL) 试剂名称 用量 蛋白酶 K 100 mg 灭菌双蒸水 5 mL A.2 10%十二烷基硫酸钠(SDS溶液,pH7.2) 试剂名称 用量 十二烷基硫酸钠 10 g 灭菌双蒸水 80 mL 浓盐酸 调 pH 至 7.2 灭菌双蒸水 加至 100 mL A.3 70 %乙醇 试剂名称 用量 无水乙醇 70 mL 灭菌双蒸水 30 mL A.4 1.0%琼脂糖凝胶 试剂名称 用量 琼脂糖 0.6 g 0.5TBE 缓冲液 60 mL _ 4

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