SN T 3767.18-2014 出口食品中转基因成分环介导等温扩增(LAMP)检测方法 第18部分 大豆 GTS40-3-2品系.pdf

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1、华人共和国出入境验检疫行标准SN/3767.18-2014 食品中等温扩增CLAMP)检测第18音出己一ue介&v可Baq 直GTS40号召晶系Loop-mediated isothermal amplification detection method for genetically modified components in food for export-Part 18: Soybean GS40-3-2 2014-01-13发布2014-08-01实施中华人民共和自发布国家服量监督检验拴菇总局SN/T 3767.18-2014 F.l1J SN/T 3767出口食品中转基因成分环介导

2、等温扩增CLAMP)检测方法共分为30部分:第1部分:通用要求和定义;第2部分:筛选方法;第3部分:玉米面11品系;第4部分:玉米面176品系;第5部分:玉米GA21品系;第6部分:玉米MIR162品系;第7部分:玉米MIR604品系;第8部分:玉米MON810品系;第9部分:玉米MON863品系;第10部分:玉米MON88017品系;第11部分:玉米MON89034品系;第12部分:玉米T-25品系;第13部分:玉米3272品系;第14部分:玉米59122品系;第15部分:大豆A270412品系;第16部分:大豆A5547-127品系;第17部分:大豆DP356043品系;第18部分:大豆G

3、TS40-3-2品系;第19部分:大豆MON89788品系;第20部分:水稻Bt-63品系;第21部分:水稻KF6品系;第22部分:水稻KF8品系;第23部分:水稻KMD品系;第24部分:水稻LLRICE62品系;第25部分:水稻M12品系;第26部分:水稻T1C-19品系;第27部分:水稻T2A-1品系;第28部分:小麦B736-1品系;第29部分:甜菜H7-1品系;第30部分:油菜RT73品系。本部分为SN/T3767的第四部分。本部分按照GB/T1.1-2009给出的规则起草。请注意本文件的某些内容可能涉及专利。本文件的发布机构不承担识别这些专利的责任。本部分由国家认证认可监督管理委员会

4、提出并归口。本部分起草单位:中华人民共和国广东出入境检验检疫局、中华人民共和国汕头出入境检验检疫局、中华人民共和国辽宁出入境检验检疫局、中华人民共和国珠海出入境检验检疫局、中华人民共和国SN/T 3767.18-2014 北京出入境检验检疫局、中华人民共和国上海出入境检验检疫局、中国检验检疫科学研究院、仲也农业工程学院、广州迪澳生物科技有限公司。本部分主要起草人:刘津、蔡颖、凌莉、易敏英、高东微、谢力、曹际娟、冯家望、曾静、李晓虹、陈颖、高苏娟、石磊、李志勇、张隽、陈源树、李婷、关丽军。H 1 范围出口食品中转基因成分环介导等温扩增CLAMP)检测方法第18部分:大豆GS40-3-2品系SNj

5、T 3767.18-2014 SNjT 3767的本部分规定了食品中转基因大豆GTS40-3-2品系特异性的环介导等温扩增(LAMP)初筛检测方法。本部分适用于大豆及其加工产品本方法的定性检测低限为0.5%(2 规范性引用文件下列文件对于本文件的应用是必不件。凡是不注日期的引用文件,其最GBjT 6682 分析实验室用GBjT 19495.2 GBj19495.3 GBjT 19495.5 GBjT 19495.7 SNjT 2668 转基因植物品系特SNjT 3767.2-2014 选方法3 防污染措施环介导等温扩增检测过程的防4 抽样与制样按照GBjT19495.7的规定执行。5 核酸提取

6、纯化按照GBjT19495.3的规定执行。6 LAMP检泪u方法6.1 原理6. 1. 1 一般原理的定性检测。根据转基因大豆GTS40-3-2品系外源基因和大豆边界序列设计的内、外引物各一对,特异性目标SN/T 3767.18-2014 序列和引物碱基序列参见附录A。引物特异性识别目标序列上的六个独立区域,利用Bst酶启动循环链置换反应,在大豆GTS40-3-2品系特异目标序列启动互补链合成,在同一链上互补序列周而复始形成有很多环的花椰菜结构的茎一环DNA混合物;从dNTP析出的焦磷酸根离子与反应潜液中的Mg2十结合,产生副产物(焦磷酸镇)形成乳白色沉淀,加入显色液,即可通过颜色变化观察判定

7、结果。6.1.2 显色液显色原理SYBR Gre巳n1是一种高灵敏的DNA荧光染料,可以嵌入方式结合到双链DNA的小沟内。当它与双链DNA结合时,荧光信号是游离状态的8001000倍。在不发生扩增反应时,SYBR染料分子的荧光信号不发生改变,颜色显现为橙色;当发生扩增反应时,随着双链DNA的增加,SYBR染料的荧光信号也随之大幅度增强,其信号强度可代表双链DNA分子的数量,同时颜色由橙色变为绿色。6.2 仪器和设备6.2.1 超纯水发生器。6.2.2 水浴锅或加热模板:63.0oC :1: 0.5 oC和80.0oC :1: 0.5 oC。6.2.3 离心管:0.1mL、1.5mL。6.2.4

8、 移液器:量程0.5L10L;量程10L100L;量程100Ll000L 6.2.5 计时器。6.3 试剂和材料除另有规定外,所有试剂均为分析纯或生化试剂。6.3.1 实验用水:应符合GB/T6682中一级水的规格。6.3.2 dNTPs榕液:每种核昔酸浓度10mmol/L。6.3.3 Bst DNA聚合酶(如:NEB公司或具有同等效果的DNA聚合酶):酶浓度8U/,uL。6.3.4 10 ThermolPol缓冲液:含200mmol/L Tris-HCl(pH值8.8)、100mmol/L硫酸镜、100mmol/L氧化仰、20mmol/L硫酸镜、1%Triton X-100。6.3.5 硫酸

9、镜溶液:150 mmol/L。6.3.6 甜菜碱:5mol/L。6.3.7 显色液:SYBRGr巴巴n1荧光染料,1000。6.3.8 引物:根据转基因大豆GTS40心品系外源基因和大豆边界序列设计一套特异性引物,包括外引物1,外引物2,内引物l和内引物2。外引物扩增片段i支度:193 bp 夕卡引物l(F3,5人3): GGAGT AGT ACACTCACCAGT 外引物2(B3 , 5 -3) : GCA TTCG AGCTTCTTCAC 内引物1(FIP,5-3) : ACAACGAGAAGCTATATGTAGATGCGACCCTAATAGGCAACAGC 内引物2(BIP , 5 -3

10、) : CAAAACT A TTTGGG A TCGGAG AAG AG AACTTCTCG ACGA TGGC 6.4 实验步骤6.4.1 阴性对照、阳性对照和空白对照的设置6.4. 1. 1 阴性对照:采用不含有待测基因序列的植物基因组DNA为模板。6.4.1.2 阳性对照:采用含有目标基因序列的植物DNA或质粒DNA作为模板,浓度应略高于方法检测低限。2 SN/T 3767.18-2014 6.4.1.3 设两个空白对照:提取DNA时设置的提取空白对照(以水代替样品); 一一LAMP反应的空白对照(以DNA溶解液代替DNA模板)。6.4.2 内源基因检测LAMP检测前应先进行内源基因检测

11、,结果阳性则表明从样品中提取的DNA可以进行外源基因检测;否则应重新进行DNA提取和纯化。内源基因的检测参照SN/T3767.2-2014的规定进行。6.4.3 大豆GTS40-3-2品系LAMP反应体系LAMP反应体系见表1。每个样品各做2个平行管。加样时应使样品DNA溶液完全加入反应液中,不要粘附于管壁上。在反应体系配制完成后,将1p.L显色液滴在管盖内侧,盖管盖时应小心,防止显色液混合进入反应液中。表1大豆GTS40田3-2晶系LAMP反应体系组分工作液浓度加样量/L反应体系终浓度ThermoPol缓冲液10 2.5 l 外侧上游引物(F3)10mol/L 0.5 0.2mol/L 外侧

12、下游寻|物CB3)10 !lmol/L 0.5 0.2mol/L 内侧上游引物(FIP)40mol/L 1. 0 1.6mol/L 内侧下游引物(BIP)40mol/L 1. 0 1.6mol/L dNTPs 10 mmol/L 4 1. 6 mmol/L 甜菜碱5 mol/L 4 0.8 mol/L 硫酸续150 mmol/L l 6 mmol/L Bst DNA聚合酶8 U/L 1 0.32 U/L DNA模板100 ng/L 2 8 ng/L 水补足至25.06.4 .4 LAMP反应参数63.0 oC :!:0.5 oC恒温扩增60mi日,80.0oC士0.5oC 5 min使酶灭活,

13、反应结束。6.4.5 显色反应反应结束后,将显色液与反应液上下颠倒轻轻棍匀,立即在黑色背景下进行颜色观察。6.5 质量控制6.5.1 基本原则:实验室中设置的各种对照LAMP检测结果应符合以下情况。否则,任一种对照如果出现非下述正常结果,应重做实验。6.5.2 空白对照:反应管中液体呈橙色。6.5.3 阴性对照:反应管中液体呈橙色。3 SN/T 3767.18-2014 6.5.4 阳性对照:反应管中液体呈绿色。7 结果判断和确证7.1 待检样品2个平行样反应管中液体均呈橙色,同时各种实验对照结果正常,可判断该样品检测结果为明性。7.2 待检样品2个平行样反应管中液体至少l管呈绿色,同时各种实

14、验对照结果正常,可判断该样品转基因大豆GTS40-3-2品系初筛阳性,还应通过下列方法之一进行确证(见附录A): 一一按照SN/T2668进行实时荧光PCR检测;按照GB/T19495.5进行实可对外引物PCR扩增产物8 结果表述8.1 8.2 检测结果为转基因大豆GTS40-3-24 SN/T 3767.18-2014 附录A(资料性附录)转基因大豆GTS40-3-2品系基因序列A.1 转基因大豆GTS40-3-2品系特异目标序列(来自Accessionno.AJ 308515.1) 719 GG 721 AGTAGTACAC 781 AAAATAGCAT 841 901 AGCTCGAA

15、TGC A.2 引物碱基序列及构成B3 , GCATTCGAGCTTC FIP , BIP: F2 AATAGGCAACAGC 5 寸户ONi己h的HZ的中华人民共和国出入境检验检疫行业标准出口食品中转基因成分环介导等温扩增(LAMP)检测方法第18部分:大豆GTS40-3-2品系SN/T 3767.18-2014 ?毛中国标准出版社出版北京市朝阳区和平里西街甲2号(100029) 北京市西城区三里河北街16号(100045) 总编室:(010)68533533网址中国标准出版社秦皇岛印刷厂印刷今专印张0.75字数10千字2014年12月第一次印刷r. 书号:155066 2-27472 定价16.00元开本880X12301/16 2014年12月第一版印数1-1300 SN/T 3767.18-2014

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