DB11 T 819-2011 锦鲤疱疹病毒病诊断技术规范.pdf

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资源描述

1、ICS 11.220 B 41 备案号:31304-2011 DB11 北京市地方 标准 DB11/T 819 2011 锦鲤疱疹病毒病诊断技术规范 Technical protocol for diagnosis of Koi Herpesvirus Disease 2011 - 08 - 09发布 2011 - 12 - 01实施 北京市质量技术监督局 发布DB11/T 8192011 I 前 言 本标准按照 GB/T 1.12009 给出的规则起草。 本标准由北京市农业局提出。 本标准由北京市农业标准化技术委员会归口。 本标准由北京市农业局组织实施。 本标准起草单位:北京市水产技术推广站

2、。 本标准主要起草人:王姝、徐立蒲、张振国、王静波、曹欢、贾丽、殷守仁。 DB11/T 8192011 1 锦鲤疱疹病毒病诊断技术规范 1 范围 本标准规定了锦鲤疱疹病毒病( KHVD)的样品要求、临床症状及流行病学特征、 PCR检测、结果判 定。 本标准适用于锦鲤疱疹病毒病的诊断。 2 规范性引用文件 下列文件对 于本文件 的应用是必不可少 的。 凡是注日期 的 引 用 文件,仅所注日期的 版本适用于本文 件。凡是不注日期的 引用文件,其最新版 本(包括所有 的 修改单)适用于本 文件。 GB/T 6682 2008 分析 实 验室 用水规格和试验方法 SC/T 7103 水生动物 产地检疫

3、采 样技术规 范 3 缩略语 下列缩略语 适用于本 文件。 KHV:锦鲤疱疹病毒( Koi herpesvirus) KHVD:锦鲤疱疹病毒病(Koi herpesvirus disease ) PCR: 聚合酶链式反应 (Polymerase Chain Reaction ) DNA:脱氧核糖核酸( Deoxyribonucleic acid) Taq酶:Taq DNA 聚合酶 ( Taq DNA polymerase) dNTP:脱氧核糖核苷三磷酸(Deoxyribonucleoside triphosphate ) 4 样品要求 4.1 水温 采集样品时 的水温应在 1632 。 4.2

4、 品种 采样品种为 锦鲤或鲤。 4.3 数量 按照SC/T 7103执行。 4.4 状态 DB11/T 8192011 2 采集的样品 不得腐败 。 4.5 信息采集 需采集鲤或 锦鲤发病 情况、混养其它鱼类发病情况 、采 样水温等信息。 5 锦鲤疱疹病毒病临床症状及流行病学特征 5.1 患 KHVD的锦鲤 和 鲤 ,具有下列 临床症状: 最显著 的特征为烂鳃, 鳃 出血并产 生大量黏液 ,鳃 丝溃烂; 体表出 现苍白的 块斑和水 泡;鳍条 和尾鳍充 血;鳞片上出现 血丝; 眼球凹陷; 口腔和 腹部充血和 出 血 。 5.2 患 KHVD的锦鲤 和 鲤 ,具有下列 流行病学特征: 混养池塘中,

5、只有 鲤或锦鲤( 且 不 论 大 小 ) 生 病 和 死亡,而其它种类, 如金鱼 、草 鱼等无此现象; 水温在18 30时, 特别是在25 28时 , 鲤或锦鲤大量死亡 ,当 水 温升高或降低 时,死亡 现象下降或 停止; 死亡极快 , 一条健康鱼从 出现临床症状到死只 有 24h48h;死亡率极高 , 疾病发生 后 在 10天内, 死亡率可达80%100% 。 6 PCR检测方法 6.1 试剂和材料 6.1.1 水:符合 GB/T 66822008 中一级水的规 格 。 6.1.2 KHV阳性核酸 片断:由农业部指 定 机构 提供。 6.1.3 Taq酶:20 保存 ,不能反 复冻融或温 度

6、剧烈变 化。 6.1.4 dNTP:10 mmoL/L。 6.1.5 氯化镁溶液浓度:25mmoL/L。 6.1.6 扩增 KHV的 TK基因中 的 409bp片断的引物 : 浓度 为 100pmoL/L 。其序列 如下: KHV-TK-F: 5-GGG-TTA-CCT-GTA-CGA-G-3; KHV-TK-R: 5-CAC-CCA-GTA-GAT-TAT-GC-3。 6.1.7 扩增 KHV的 Sph基因中 292bp片断的引物 : 浓度 为 100pmoL/L。 其序列如 下: KHV-Sph-F: 5-GAC-ACC-ACA-TCT-GCA-AGG-AG-3; KHV-Sph-R: 5

7、-GAC-ACA-TGT-TAC-AAT-GCT-CGC-3。 6.1.8 DEPC水:用 焦碳酸二 乙酯(DEPC)处理过 的水。 6.2 器材和设备 6.2.1 普通冰箱和 超低温冰箱 。 6.2.2 组织研磨器 。 DB11/T 8192011 3 6.2.3 离心机和离心管。 6.2.4 PCR扩增仪。 6.2.5 水平电泳仪 。 6.2.6 微量移液器 及吸头。 6.2.7 紫外观察灯 或凝胶成像仪。 6.3 样品处理 6.3.1 体长小于 4cm的 鱼 苗取整条鱼, 体 长 4cm 6cm的鱼 苗取内脏( 包括肾) , 体长大 于 6cm的鱼 则 取肾、脾、 鳃;无临床症状的 鱼,

8、另外 需加取肠 和脑 组织。 6.3.2 将所取样品 匀浆成糊 状,按 1:10 的最 终稀释度 悬于 磷酸盐缓冲 液(参见附录 A.1)。 6.3.3 将 450L 悬 液放入 1.5mL的离心管,再加入 450LCTAB 溶液(参见附录 A.2)并混 匀,25 作用 2小时 。 6.4 DNA抽提 在含有样品的离心管中加入 600L抽提 液(参见附录 A.3),用力 混合。12000r/min离心 5min, 取上层水相 ( 约800L )。再加入 700L抽 提液 ( 参见附录A.4 ) , 用力混合 。 12000r/min离心 5min, 取上层水相(约 600L)。 再加入预冷 的

9、 1.5倍 体积 的无水乙醇(约 900L) ,倒置数次 混匀后,放置 离心管于20下,至少8h 后取出。12000r/min 离心 30min,倒去上 清液。将离心管倒置 于吸水纸上 , 吸干液体。 加11L DEPC水溶 解后,作 为PCR模板 。 6.5 DNA扩增 6.5.1 使用 KHV-TK引物的反应 体 系为 100L :在 0.2mL反应 管 中 加入 10 L模板 、 2.5L dNTP 、 10L 氯化 镁溶液、10 L 10倍 Taq酶 缓冲液 (参见附录 A.5)、 KHV-TK-R和 KHV-TK-F 各 1L、2.5U Taq酶、加 DEPC水至 100L。 将反应

10、管置 于 PCR扩增 仪 。 反应 程序:94 变性 5min;95 变性 1min、 50退火 1min、 72 延伸 1min,40 次 循环;72 延伸 10min;4 保温。 6.5.2 使用 KHV-Sph引物的 反应体系 为 100L :在 0.2mL反应 管 中 加入 10 L模板 、 2 L dNTP、8 L氯化镁溶液 、10L 10 倍 Taq酶 缓冲液、 KHV-Sph-R和 KHV-Sph-F各 0.5 L、 2.5U Taq酶、 加 DEPC 水至 100L 。 将反应 管置于 PCR扩增仪 。 反应程 序: 94 变性 30s; 94变性 30s、 63 退火 30s

11、、 72 延伸 30s,40 次 循环 ;72延伸 7min; 4保温 。 6.6 设立对照 6.6.1 在 6.3样品 处理过程 中应设立 阳性样品 对照、阴 性样品 对 照、空 白对照。 6.6.2 取 KHV阳性 核酸片断 作为阳性 对照。 6.6.3 取正常的鱼 组织抽提 核酸作为 阴性对照。 6.6.4 取等体积的水 代替模板作为空 白对照。 6.7 琼脂糖电泳 用TBE电泳缓冲 液(参见附录 A.6), 配制1.5%的 琼脂 糖平板(含1L/mL EB, 参见附录A.7 )。将 平板放入水平电泳槽,使电泳缓冲液 刚好淹没 胶面。 将6L样品和2 L上样缓冲 液(参见附录A.8) ,

12、 按比例混匀 后加入样品 孔 。 在电泳时使 用核酸分 子量 标准参考物 作对照。 5V/cm电泳约 0.5h,当溴酚蓝 到 达底部时停止 。 DB11/T 8192011 4 7 结果判定 7.1 PCR检测结果的判读即 在 紫外 光下观察 扩增带。用 KHV-TK 基因引物, PCR后阳性 对 照会出 现一条 409bp的 DNA片段; 用 KHV-Sph基因引物,PCR 后阳性 对 照会出 现一条 292bp的 DNA片 段 。阴 性 和 空白 对 照 无上述 核酸带。 7.2 如果被检测样品有临床症状,PCR 后能 够得到 409bp和/或 292bpDNA片段者 , 则 可确 诊 为

13、 KHVD。 7.3 无临床症状样品,PCR 后能够 得到 409bp和 /或 292bpDNA片段者, 则判定样品为 KHV可 疑 。可 疑 的样品可经 基因测序 确定是 KHV后 , 判定 为 KHV阳性 。 7.4 PCR后没有得 到 409bp和 292bpDNA片段者 , 判定 为 KHV阴性。 DB11/T 8192011 5 附 录 A (资料性附 录) 试剂配制 A.1 磷酸盐缓冲液 称 取 氯 化 钠 ( NaCl) 7.9g, 氯化 钾 (KCl) 0.2g,磷酸二 氢钾 (KH 2PO4) 0.24g,磷酸氢 二钠 (Na 2HPO4) 1.8g,溶于800mL蒸馏 水中

14、,调节 溶液酸 碱度至7.4,最 后 加 蒸馏 水定容至1L 。 A.2 CTAB溶液 按CTAB(hexadecyl trimethy ammonium bromide)2% , 氯 化 钠 ( NaCl)1.4moL/L ,乙二胺四 乙酸 (EDTA)20mmoL/L,三羟 基氨基甲烷 盐酸(Tris-HCl )20mmoL/L配制 , 调节溶液 酸 碱 度 至 7.5,用前 加 巯基乙醇至终 浓度为0.25%。 A.3 抽提液 1 mmoL/L 三 羟基氨基 甲烷饱和 酚(Tris- 饱 和 酚)、 三氯甲烷(CHCl 3)、异戊 醇(C 5H12O)按 25: 24:1的比例 混合,密

15、闭避光保存 。 A.4 抽提液 三氯甲烷(CHCl 3)、异戊 醇(C 5H12O)按 24:1的 比例 混合,密闭避光保存 。 A.5 10倍Taq酶缓冲液 按三羟基氨 基甲烷盐 酸 (Tris-HCl,酸 碱 度 8.8) 500mmoL/L, 氯化 钾 (KCl) 500mmoL/L,聚 乙 二 醇 辛 基 苯 基 醚 ( Triton X-100)1% 配制。 A.6 TBE电泳缓冲液(5 倍浓 缩 ) 称 取 三 羟 基氨 基 甲烷 (Tris ) 54g, 硼 酸 (HBO 3) 27.5g, 乙二胺四 乙 酸 ( EDTA) 2.9g, 加 水至1000mL , 用 稀盐酸(HCl)调节 酸碱度到 8.0。 A.7 EB (Ethidium Bromide,核酸染色剂) 用水配制 成 10mg/L的浓缩液 。用时每 10mL电泳 液或 琼脂中加 1L。 A.8 6上样缓冲液 溴酚蓝100mg, 加双蒸水5mL,在室温下 过 夜 , 待溶 解后 再 称 取 蔗 糖 25g,加双蒸 水溶解后移入 溴酚 蓝溶液中, 摇匀后定 容至50mL ,加入氢 氧化钠1 滴, 调至蓝色。 _

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