1、ICS DB51 四川省地方标准 DB51/T 12032011 马铃薯 M 病毒、马铃薯 S 病毒检疫鉴定技术规程Detection and Identification of Potato Virus M and Potato Virus S for Quarantine 2011 - 01 - 25 发布 2011 - 03 - 01 实施四川省质量技术监督局 发布DB51/T 12032011 I 目 次 前言 II 1 范围 1 2 规范性引用文件 1 3 术语和定义 1 4 原理 1 5 试剂与材料 1 6 仪器及用具 3 7 取样 3 8 实验室检验 3 9 结果判定 4 10
2、样品保存 . 4 附录A(资料性附录) 马铃薯M病毒、马铃薯S病毒基本信息 5 附录B(资料性附录) 马铃薯M病毒DAS-ELISA检验程序 6 附录C(资料性附录) 马铃薯S病毒DAS-ELISA检验程序 8 附录D(资料性附录) 马铃薯M病毒RT-PCR检验程序 10 附录E(资料性附录) 马铃薯S病毒RT-PCR检验程序 12 DB51/T 12032011 II 前 言 本标准分为范围、规范性引用文件、 术语和定义、原理、试剂与材料、仪器及用具、取样、实验室检验、结果判断、样品保存等部分。 本标准由四川省农业厅提出并归口。 本标准起草单位:四川省农业厅植物检疫站。 本标准主要起草人:宁
3、红、万佳、刘可、郭迪金、吴志平、黄玲、李耄 DB51/T 12032011 1 马铃薯 M 病毒、马铃薯 S 病毒检疫鉴定技术规程 1 范围 本标准规定了马铃薯M病毒(见附录A)、马铃薯S病毒(见附录A)的取样、实验室检验、结果判断及样品保存的技术要求和方法。 本标准适用于马铃薯感染马铃薯M病毒、马铃薯S病毒的检验和鉴定。 2 规范性引用文件 下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅所注日期的版本适用于本文件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。 GB15569-2009 农业植物调运检疫规程 DB51/T868-2009 马铃薯卷叶病毒、
4、马铃薯Y病毒和马铃薯A病毒检验鉴定技术规程 3 术语和定义 下列术语和定义适用于本标准。 3.1 目标条带 target band 根据某种病毒RNA序列中一段保守的、特异的碱基序列设计特异引物,通过RT-PCR扩增和电泳检测,得到的与引物设计长度吻合的RT-PCR扩增条带。目标条带的存在,是判断某种病毒存在的标准。本标准中PVM的目标条带为630bp,PV S的目标条带为435bp。 注:改写DB51/T868-2009,定义3.6。 4 原理 两种病毒田间通过蚜虫和农事操作进行传播,远距离主要通过人为的引种、商品流通等途径传播,带毒块茎和种苗是该病毒远距离传播的主要载体,两种病毒具有潜隐性
5、,根据病害症状很难确定马铃薯M病毒和马铃薯S病毒的病毒种类,薯块上一般不表现症状。采用免疫学和分子生物学方法,可快速根据有关判断标准进行马铃薯M病毒、马铃薯S病毒检验鉴定。 5 试剂与材料 除非另有说明,在本标准中仅使用确认的分析纯试剂和蒸馏水或去离子水或相当纯度的水。 5.1 免疫学检验试剂 5.1.1 捕捉抗体(Capture antibody) 5.1.1.1 马铃薯 M 病毒免疫球蛋白,抗体稀释度按市售产品要求进行。贮藏于 4条件下备用。 DB51/T 12032011 2 5.1.1.2 马铃薯 S 病毒免疫球蛋白,抗体稀释度按市售产品要求进行。贮藏于 4条件下备用。 5.1.2 酶
6、标抗体(Alkaline phosph atase enzyme conjugate) 5.1.2.1 用碱性磷酸酶标记的马铃薯 M 病毒的免疫球蛋白抗体。按市售产品要求进行稀释,贮藏于 4 条件下备用。 5.1.2.2 用碱性磷酸酶标记的马铃薯 S 病毒的免疫球蛋白抗体。按市售产品要求进行稀释,贮藏于 4 条件下备用。 5.1.3 包被缓冲液(Coating buffer) 取 2.93 g碳酸氢钠(NaHCO 3)、1.59 g碳酸钠(Na 2CO3)、0.2 g叠氮化钠(NaN 3),用 1000 mL蒸馏水溶解,并调pH值到 9.6,贮藏于 4条件下备用。 5.1.4 洗涤液(PBST
7、 Buffer) 取 1.15 g无水磷酸氢二钠(Na 2HPO4)、0.2 g氯化钾(KCl)、0.2 g无水磷酸二氢钾(KH 2PO4)、8.0 g氯化钠(NaCl)、0.5 g 吐温20 ,用 1000 mL蒸馏水溶解,并调整pH值到 7.4。 5.1.5 样品提取液(GEB buffer) 取 1.3 g无水硫酸钠(Na 2SO4)、20.0 g聚乙烯吡咯烷酮(C 6H9NO)24-40000)、0.2 g叠氮化钠(NaN 3)、2.0 g 级鸡蛋清白蛋白粉、20.0 g 吐温20,用 1000 mL洗涤液溶解,并调整pH值到 7.4,贮藏于 4条件下备用。 5.1.6 酶标抗体稀释缓
8、冲液(ECI Buffer) 取 0.2 g牛血清白蛋白(或脱脂奶粉)、2.0 g聚乙烯吡咯烷酮(C 6H9NO)n)、0.02 g叠氮化钠(NaN 3),用 100 mL洗涤缓冲液溶解,并调整pH值到 7.4,贮藏于 4条件下备用。 5.1.7 底物缓冲液(PNP Buffer) 用 80 mL灭菌蒸馏水将 0.01 g氯化镁(MgCl 2)、0.02 g叠氮化钠(NaN 3)、9.7 mL二己醇胺CH 2CH2OH)溶解后,用盐酸调pH值到 9.8,定容到 100 mL,贮藏于 4条件下备用。 5.1.8 底物溶液(PNP substate) 将 5mg 对硝基苯磷酸盐(C 6H5NO3)
9、溶解于 5 mL 底物缓冲液中。底物溶液制备需在孵育结束前 15 min内,避光条件下制备。 5.1.9 终止液 12 g 氢氧化钠(NaOH)溶于 100 mL 蒸馏水。 5.2 RT-PCR 检验试剂 5.2.1 莫洛尼鼠白血病病毒反转录酶(MMLV) 100 U/l。 5.2.2 1 TAE 缓冲液 40mM Tris-H Cl, 20mM NaAc, 2mM E DTA(用冰醋酸调 pH 至 8.0)。 5.2.3 5 RT 缓冲液(5x RT Buffer) 50 mM Tis-HCl PH7.5, 100 mM NaCl, 0.1 mM EDTA, 10 mM DTT, 0.01%
10、 NP-40,50%甘油。 5.2.4 10 PCR 缓冲液 100 mM Tris-HCl (pH8.3), 500 mM KCl。 5.2.5 MgCl2 25 mM。 5.2.6 RNA 酶抑制剂(RNasin) 10 U/l。 5.2.7 RT 增强剂(RT Ehancer)。 5.2.8 无水乙醇(CH 3CH2OH)。 5.2.9 RL 裂解液。 5.2.10 去蛋白液。 5.2.11 Taq 酶 2.5 U/l。 5.2.12 dNTP Mixture 10 mM。 5.2.13 漂洗液。 5.2.14 双蒸水(ddH 2O)。 5.2.15 2-巯基乙醇(MCE)C 2H6OS
11、。 5.2.16 液氮 (N 2)。 5.2.17 引物 DB51/T 12032011 3 5.2.17.1 PVM 上游引物(P1)碱基序列: 5- CGCATAC AATATCTGGACTTACAC-3,下游引物(P2)碱基序列: 5-CTACTCCA GTAATGCAACTCATC-3,用双蒸水稀释至 20M。 5.2.17.2 PVS 上游引物(P1)碱基序列: 5- TTCCAGA GGACGCCTTTGCAATC-3,下游引物(P2)碱基序列: 5- GTCTAAC TGGCATCAGGGCACAATA-3,用双蒸水稀释至 20M。 5.2.18 100bp DNA ladder
12、 (1500 bp) 5.2.19 溴酚蓝(Bromophenol blue)C 19H10Br4O5S。 5.2.20 琼脂糖凝胶 称取 1.5 g 琼脂糖缓缓倒入 250 mL 三角瓶内,加入 100 mL 1TAE,在微波炉中加热 1 min 溶解后,再加入 5 L Goldview 的生物染料,倒入调平并安放适当梳齿的制胶板上,冷凝后小心拔出梳齿。 6 仪器及用具 仪器及用具包括: 聚乙烯微量滴定板 根据样品数量选用40孔和96孔两种规格; 移液器 2 L10 L、10 L50 L、10 L200 L、200 L1000 L和1 mL5 mL五种规格及配套吸头; 天平 1/100 g,
13、1/1000 g; 培养箱; 台式高速离心机; 酶联免疫检测仪; 水平电泳仪; 凝胶成像系统; PCR扩增仪; EP管; 研钵 内径60 mm80 mm; 剪刀; 冰箱; 超低温冰箱; 过滤柱 CS过滤柱,CR吸附柱; 涡旋混匀器。 7 取样 7.1 植株取样 取样方法按DB51/T868-2009 7.2和D B51/T868-2009 7.3的规定。 7.2 种薯(块茎)取样 按GB15569-20 09 6.2的规定进行抽样。 8 实验室检验 8.1 DASELISA DB51/T 12032011 4 8.1.1 马铃薯 M 病毒检验方法见附录 B。如采用认可的试剂盒,按说明操作。 8
14、.1.2 马铃薯 S 病毒检验方法见附录 C。如采用认可的试剂盒,按说明操作。 8.2 RT-PCR 8.2.1 马铃薯 M 病毒样品的制备与检验方法见附录 D。如采用认可的试剂盒,按说明操作。 8.2.2 马铃薯 S 病毒样品的制备与检验方法见附录 E。如采用认可的试剂盒,按说明操作。 9 结果判定 9.1 DASELISA 在阴性对照OD值0.1,且阳性对照OD值大于阴性对照OD值2倍的前提下,样品孔OD值大于阴性对照OD值2倍时,判定为阳性反应,即样品带相应的被检病毒;否则判定为阴性反应,即样品不带相应的被检病毒。 9.2 RT-PCR 在阴性对照无扩增条带, 且阳性对照出现630 bp
15、目标条带的前提下, 样品RT-PCR产物电泳结果在630 bp处出现目标条带,判定为阳性反应,即样品带PVM病毒;否则判定为阴性反应,即样品不带PVM病毒。 在阴性对照无扩增条带, 且阳性对照出现435 bp目标条带的前提下, 样品RT-PCR产物电泳结果在435 bp处出现目标条带,判定为阳性反应,即样品带PVS病毒;否则判定为阴性反应,即样品不带PVS病毒。 10 样品保存 经检疫鉴定后的样品,应在-80-20保存三个月,以备复验、谈判和仲裁,保存期满后,需进行灭活处理。 DB51/T 12032011 5 AA 附 录 A (资料性附录) 马铃薯 M 病毒、马铃薯 S 病毒基本信息 A.
16、1 分类 A.1.1 马铃薯M病毒 pot ato virus M 简称PVM。属香石竹潜隐病毒属。病毒粒体微曲线状,大小65012nm,致死温度6571,稀释限点1001000倍,20体外存活期几天。引起马铃薯小叶病。 A.1.2 马铃薯S病毒 pot ato virus S 简称PVS。属香石竹潜隐病毒属。病毒粒体线形,长650nm,病汁液稀释限点110倍,钝化温度5560,体外存活期34天。在马铃薯上引起轻度皱缩花叶或不显症,其寄主范围较窄,系统侵染的植物仅限于茄科的少数植物 A.2 为害 A.2.1 马铃薯M病毒为害症状 马铃薯M病毒寄主范围窄,主要侵染茄科,还可侵染藜科和豆科植物。P
17、VM强株系侵染后,马铃薯幼苗期小叶片表面有油脂状光泽,同时小叶迅速开始向下卷曲,叶背出现条斑坏死;随着马铃薯生长发育,产生明显花叶,叶片严重变形,并很快黄化至干枯;病株严重萎缩和矮化,其株高只相当于健株的1/3高度。PVM的弱株系侵染马铃薯后,常引起病株小叶脉间花叶、畸形和顶叶卷曲。植株受PVM浸染后,温度在24以上,病症隐蔽。该病毒是马铃薯上常见的病害,可引起较大的产量损失,在东欧引起的产量损失达40%。PVM和同属的PVS常常同时在马铃薯植株中存在。 A.2.2 马铃薯S病毒为害症状 马铃薯S病毒单独侵染时常常不表现症状,可持续存在马铃薯薯块中,并通过薯块作远距离传播。在田间该病毒传播很快
18、,传播范围广,既可通过叶片接触传播,也可通过蚜虫传播,种植一季后感染率可高达70%,可使马铃薯减产10-20% 。当与马铃薯X病毒混合侵染时,可减产20-30%。 A.3 传播途径 两种病毒田间通过蚜虫和农事操作进行传播,远距离传播主要通过人为的引种、商品流通等,带毒块茎和种苗是该病毒传播的主要载体。 DB51/T 12032011 6 BB 附 录 B (资料性附录) 马铃薯 M 病毒 DAS-ELISA 检验程序 B.1 包被抗体 B.1.1 包被 向酶联反应板每孔加入100 L用包被缓冲液稀释的PVM捕捉抗体,将酶联反应板置于保湿容器中,室温孵育4 h 或4 冰箱过夜。 B.1.2 洗板
19、 向每个反应孔中加入200 L洗涤液,迅速倒出,重复2次。洗板完成后将酶联板倒置于吸水纸上,吸干反应孔中残留液体。 B.2 点样 B.2.1 样品制备 将待测样品剪碎,取0.3 g于研钵中,加入1 mL样品提取液 充分研磨后,再加入2 mL样品提取液充分研磨至均匀。剩余样品于-20冰箱保存备查,在制样时应注意防止样品的交叉污染。 B.2.2 点样 用移液器将制备好的样品加入酶联反应板孔内,每个样品三次重复,每孔100 L。设置阳性对照、马铃薯健康组织研磨液阴性对照和包被缓冲液空白对照。加样完成后将酶联反应板置于保湿容器中,室温孵育2 h或4冰箱12 h。 B.2.3 洗板 在每个反应孔加满洗涤
20、液,迅速倒出,再加满洗涤液,静置3 min后将洗涤液迅速倒出。重复3次。洗板完成后将酶联板倒置于吸水纸上,吸干反应孔中残留液体。 B.3 结合酶标抗体 B.3.1 加酶标抗体 向酶联反应板每孔加入100 L用PVM酶标抗体稀释缓冲液按比例稀释的酶标抗体溶液。置于保湿容器中室温孵育2 h。 B.3.2 洗板 同B.2.3。 B.4 显色 每孔加入100 L 底物溶液。25避光孵育30 min60 min,至阳性对照显色。 DB51/T 12032011 7 B.5 终止反应 显色后在每孔中加入50 L 终止液。记录检测结果,存档备查。 B.6 结果测定和记录 用酶联检测仪测定并记录光密度值(OD
21、值)。 DB51/T 12032011 8 CC 附 录 C (资料性附录) 马铃薯 S 病毒 DAS-ELISA 检验程序 C.1 包被抗体 C.1.1 包被 向酶联反应板每孔加入100 L用包被缓冲液稀释的PVS捕捉抗体,将酶联反应板置于保湿容器中,室温孵育4 h 或4 冰箱过夜。 C.1.2 洗板 向每个反应孔中加入200 L洗涤液,迅速倒出,重复2次。洗板完成后将酶联板倒置于吸水纸上,吸干反应孔中残留液体。 C.2 点样 C.2.1 样品制备 将待测样品剪碎,取0.3 g于研钵中,加入1 mL样品提取液 充分研磨后,再加入2 mL样品提取液充分研磨至均匀。剩余样品于-20冰箱保存备查,
22、在制样时应注意防止样品的交叉污染。 C.2.2 点样 用微量进样器将制备好的样品加入酶联反应板孔内,每个样品三次重复,每孔100 L。设置阳性对照、马铃薯健康组织研磨液阴性对照和包被缓冲液空白对照。加样完成后将酶联反应板置于保湿容器中,室温孵育2 h或4冰箱12 h。 C.2.3 洗板 在每个反应孔加满洗涤液,迅速倒出,再加满洗涤液,静置3 min后将洗涤液迅速倒出。重复3次。洗板完成后将酶联板倒置于吸水纸上,吸干反应孔中残留液体。 C.3 结合酶标抗体 C.3.1 加酶标抗体 向酶联反应板每孔加入100 L用PVS酶标抗体稀释缓冲液按比例稀释的酶标抗体溶液。置于保湿容器中室温孵育2 h。 C
23、.3.2 洗板 同C.2.3。 C.4 显色 每孔加入100 L 底物溶液。25避光孵育30 min60 min,至阳性对照显色。 DB51/T 12032011 9 C.5 终止反应 显色后在每孔中加入50 L 终止液。记录检测结果,存档备查。 C.6 结果测定和记录 用酶联检测仪测定并记录光密度值(OD值)。 DB51/T 12032011 10 DD 附 录 D (资料性附录) 马铃薯 M 病毒 RT-PCR 检验程序 D.1 PVM模板RNA的制备 采用TIANGEN RNApre p Plant Kit试剂盒(给出该试剂盒信息是为了方便标准使用者,如果等效产品具有相同效果,则可使用这
24、些等效产品)提取马铃薯卷叶病毒RNA。称取50 mg100 mg的马铃薯叶片或茎杆(薯块需经发芽后切取幼芽),在液氮中迅速研磨成粉末状,转移粉末至预冷的1.5 mL的EP管中,加入500 L的RL裂解液(使用前按RL裂解液1 mL 加入2-巯基乙醇10 L),涡旋剧烈震荡5 min使其混匀。 将匀浆液转移至CS过滤柱上, 12000 rpm 离心2 min5 min, 小心吸取上清液至无RNA酶 (RNase-free)的离心管中,吸头尽量避免接触收集管中的细胞碎片沉淀。缓慢加入上清液0.5倍体积无水乙醇,混匀,得到的溶液和沉淀一起转入CR吸附柱中,12000 rp m离心1 min,弃掉收集
25、管中的废液,将吸附柱放回收集管中。向吸附柱CR中加入700 L去蛋白液RW1,12000 rpm 离心1 min,弃废液,将吸附柱放回收集管中。向吸附柱CR中加入500 L漂洗液RW,12000 rpm离心1 min,弃废液,将吸附柱放回收集管中,重复漂洗一次。漂洗完后,将吸附柱在12000 rpm 离心2 min,,去除残余液体,并在室温下放置片刻。将吸附柱放入一个新的RNase-free离心管中, 向膜中央加入50 L100 L无RNA酶的双蒸水, 室温放置2 min,12000 rpm离心2 min,得到RNA溶液。 D.2 RT-PCR扩增 D.2.1 反转录 D.2.1.1 反应体系
26、 RT反应体系见表D.1。 表D.1 马铃薯 M 病毒 RT 反应体系 反应物 模板RNA P2 RNasin RT Ehancer 5 RT buffer dNTP MMLV 无RNA酶的 ddH2O 加入量( L) 2.5 0.5 0.5 0.5 4 1 0.5 10.5 D.2.1.2 程序 反转录程序为:42,50 min;94,5 min;4保存。 D.2.2 PCR反应 D.2.2.1 反应体系 PCR反应体系见表D.2。 表 D.2 PCR 反应体系 反应物 10PCR Buffer dNTP P1 P2 cDNA TaqDNA 聚合酶 MgCl2无RNA酶的ddH2O加入量(L
27、 ) 2.5 0.5 1 1 4 0.5 1.5 14 DB51/T 12032011 11 D.2.2.2 反应程序 反应程序为:943 min;9430 sec,5930 sec,7230 sec,30次循环;7210 min;4 保存。 D.3 扩增产物检测 D.3.1 琼脂糖凝胶电泳 将制胶板同制好的琼脂糖凝胶一并放入水平电泳槽,取5 L扩增反应物加0.5 L的溴酚蓝上样缓冲液混匀,以及2 L 100bp DNA ladder分别点入样孔内。电泳缓冲液1TAE适量,100 V,电泳30 min。 D.3.2 结果观察和记录 电泳结束后,取出琼脂糖凝胶,放入凝胶成像系统中,观察并记录DN
28、A条带有无和片段大小。 DB51/T 12032011 12 EE 附 录 E (资料性附录) 马铃薯 S 病毒 RT-PCR 检验程序 E.1 PVS模板RNA的制备 同D.1。 E.2 RT- PCR扩增 E.2.1 反转录 E.2.1.1 反应体系 RT 反应体系见表 E.1。 表E.1 马铃薯 S 病毒 RT 反应体系 反应物 模板 RNA P2 RNasin RT Ehancer 5 RT buffer dNTP MMLV 无RNA酶的ddH2O加入量(L ) 2.5 0.5 0.5 0.5 4 1 0.5 10.5 E.2.1.2 程序 反转录程序为:42 ,50 min;94 ,
29、5 min;4 保存。 E.2.2 PCR反应 E.2.2.1 反应体系 PCR反应体系见表E.2。 表E.2 PCR 反应体系 反应物 10PCR Buffer dNTP P1 P2 cDNA TaqDNA 聚合酶 MgCl2无RNA酶的ddH2O 加入量(L ) 2.5 0.5 1 1 4 0.5 1.5 14 E.2.2.2 反应程序 反应程序为:94 3 min;94 30 sec,59 30 sec,72 30 sec,30次循环;72 10 min;4 保存。 E.3 扩增产物检测 E.3.1 琼脂糖凝胶电泳 将制胶板同制好的琼脂糖凝胶一并放入水平电泳槽,取5 L扩增反应物加0.5 L的溴酚蓝上样缓冲液混匀,以及2 L 100bp DNA ladder分别点入样孔内。电泳缓冲液1TAE适量,100 V,电泳30 min。 DB51/T 12032011 13 E.3.2 结果观察和记录 电泳结束后,取出琼脂糖凝胶,放入凝胶成像系统中,观察并记录DNA条带有无和片段大小。 _